Química orgánica



CURSO BREVE DE QUÍMICA ORGÁNICA
Este libro de texto ha sido escrito para los estudiantes cuyo principal interés no es el área de la Química, sino que estudian otras áreas donde es necesario, desde el punto de vista profesional, un conocimiento básico de la Química orgánica. De acuerdo con esto se ha elegido como materia incluida todo aquello de importancia fundamental y del máximo interés para estos estudiantes no sólo para sus cursos posteriores sino también para la vida misma.ÍndicePrincipios generales. Hidrocarburos saturados. Hidrocarburos insaturados. Olefinas y acetilenos. Hidrocarburos aromáticos o arenos. Gas natural, petróleo y productos petroquímicos. Estereoisometría. Compuestos orgánicos halogenados. Alcoholes, fenoles y éteres. Aldehídos y cetonas. Los ácidos carboxílicos y sus derivados. Grasas, aceites, ceras; jabones y detergentes. Ácidos bifuncionales. Aminas y otros compuestos nitrogenados. Carbohidratos. Aminoácidos, péptidos y proteínas. Los ácidos nucleicos. Compuestos heterocíclicos. Productos naturales. El color en los compuestos orgánicos; colorantes.

FUNDAMENTOS DE QUÍMICA ORGÁNICA. ESTRUCTURA Y PROPIEDADES DE LOS COMPUESTOS ORGÁ
El libro describe las bases de la química orgánica, para que el alumno pueda enfrentarse con éxito a una química orgánica general. Está escrito para que su contenido se pueda impartir durante un semestre y está dividido en tres partes: la primera, la más extensa, describe la estructura de los compuestos orgánicos, junto con su clasificación y nomenclatura; la segunda introduce las reacciones orgánicas; y la tercera recoge numerosos problemas agrupados de acuerdo con los temas tratados.

ESTUDIO BIOQUÍMICO, GENÉTICO Y BIOTECNOLÓGICO DE LAS RUTAS METABÓLICAS RESPONSABLES DE LA DEGRADACIÓN DE TIRAMINA Y DE ÁCIDO 4-OH-FENILACÉTICO EN PSEUDOMONAS PUTIDA U.
ÍndiceINTRODUCCION LBIODEGRADACION DE AMINAS BIOGENICAS. 1.1.Aminas biogénicas. Aspectos generales 1.2.Aminas biogénicas como neurotransmisores. 1.3.Presencia de aminas biogénicas en los alimentos. - Presencia de aminas en alimentos no fermentados - Presencia de ominas en alimentos fermentados. 1.4.Toxicología de las aminas biogénicas. 1.5.Producción de aminas biogénicas. 1.5.1 Descarboxilación aminoácidos Q. -1.5.2.Microorganismos productores de oaminas biogénicas. 1.6.Mét0dos analiticos aplicados 21 la valoracién dé la capacidad de producción de aminas por parte de los microorganismos: Detección y cuantificación 1.6.1.Métodos para detectar microorganismos con capacidad aminobiogénica 1.6.2. Métodos analíticos para detectar animas en alimentos 1.7.Degradación de aminas biogénicas 1.7.1.Quinoproteinas amino oxidasas. 1.7.2. Quinohemoproteínas amino deshidrogénasas. 1.7.3. Quinohemoproteínas amino deshidrogénasas 1.7.4. Desaminación de tiramina OBJETIVOS MATERIALES Y METODOS. MICROORGANISMOS UTILIZADOS 2.VECTORES UTILIZADOS. 3.MEDIOS DE CULTIVO 4.MANTENIMIENTO Y CRECIMIENTO DE LOS MICROORGANISMOS 5.ADITIVOS SUPLEMENTADOS ALOS MEDIOS DE CULTIVO. 6.METODOS GENERALES PARA EL ANALISIS Y/O TRATAMIENTO DE LAS MUESTRAS DE DNA. 6.1.Aislamiento de DNA genómico de Pseudomonas putida 6.2.Aislamiento de DNA plasmídico de Lactocococcus. 7. TRANSFORMACION DE LACOTOCOCCUS LACTIS. 8. ANALISIS DE LAS SECUENCIAS DE DNA. 9. OBTENCION DE CEPAS MUTANTES DE P. PUTIDA. 9.1. Mutagénesis con el transposón Tn5. 9.1.1. Identificación del punto de inserción del transposón Tn5 en el DNA genómico 9.1.2. Identificación del punto de inserción del transposón Tn5 en el DNA genómico mediante la estrategia de “recombinación en el brazo del Tn5”. 9.1.3. Secuenciación de las zonas adyacentes a un fragmento de secuencia conocida. 9.2. Disrupción genética mediante recombinación de un fragmento homólogo 9.3. Obtención·de mutantes mediante deleción 10. ANALISIS DE LOS CALDOS IDE CULTIVO MEDIANTE CROMATOGRAFIA LIQUIDA DE ALTA RESOLUCION (HPLC) 11. DETERMINACION DE LA ACTIVIDAD 4-HIDROXIFENILACETATO 3-HIDROXILÁSICA RESULTADOS Y DISCUSION 1. AISLAMIENTO DE- MUTANTES INCAPACES DE DEGRADAR TIRAMINA. 2. ANALISIS MEDIANTE 5 HPLC DE LOS METABOLITOS ACUMULADOS EN LOS CALDOS DE CULTIVO POR LOS DISTINTOS MUTANTES. 3. IDENTIFICACION DEL PUNTO DE INSERCION DEL TRANSPOSON TN5 Y SECUENCIACION DE LAS ZONAS ADYACENTES 3.1. Identificación del punto de inserción del transposón Tn5 en el DNA genómico mediante la estrategia de "recombinación en el brazo del Tn5" 4. ANALISIS DE LOS DIFERENTES CLUSTERS IMPLICADOS EN LADEGRADACION DE TIRAMINA Y DE ACIDO 4-OH-FENILACETICO EN P.PUTIDA U. 4.1.Ruta catabólica de degradación de tiramina. 4.1.1 Organización genética del cluster tyn. 4.1.1.1.Desamil1aci6n de la tirzuijina. - Gen tynA - Gen tynB - Gen tynC 4.1.1.2. Oxidación de1 4-hidroxifenilacetaldehódo. - Gen tynC - ORF 2 4.1.1.3. Regulación de la ruta tyn de Conversión de la- tiramina; en 4-OH-PhAc - Gen tynC 4.1.1.4. Otros ORFs presentes en el cluster tyn. - ORF 1. - ORF 3. 4.1.2.Análisis comparativo de otros posibles cluster tyn presentes en diferentes microorganismos. 4.2. Ruta catabólica de degradación dé ácido 4-OH-fenilacético. 4.2.1. Organización genética del cluster hpa en P. putida U. 4.2.1.1. Hidroxi1ación del 4-OH-PhAc - Operon hpaBC. 4.2.1.2. Etapa responsable de. la apertura en meta del anillo aromático del 3,4-diOH-PhAc. - Gén hpaD 4.2.1.3. Continuación de la ruta meta de degradación del 3,4-diOH-PhAc - Gen hpaE - Gen hpaF - Gen hpaG - Gen·hpaH - Gen hpaI 4.2.1.4. Transporte del 4-OH-PhAc - Gen hpaX 4.2.1.5. Regulación de la ruta de degradación de1 3,4-diOH-PhAc - Gen hpaE - Gen hpaR - Gen tetR 4.2.2. Análisis comparativo del cluster hpa en otros· microorganismos. 5. ANÁLISIS DE RESTRICCIÓN DE LOS CLUSTER TYN Y HPA DE P. PUTIDA U. 6. SECUENCIA DE LOS CLUSTER TYN Y HPA- DE P. PUTIDA U. 7. EXPRESIÓN HETERQLOGA DE LOS GENES IMPLICADOS EN LA DEGRADACIÓN DE TIRAMINA Y DE 4-OH-PHAC EN P. PUTIDA U - Wpk-TBamHI - WpK-TE y WpK-TE-B - WpK-Tyr - WpK-Tyr-6 - WpK-Tyr-2 - WpK-Tyr­4 - KT2440pK-TyrOH 8. ESTUDIO DE LA CAPACIDAD DEL CLUSTER TYN PARA DESAMINAR OTRAS AMINAS AROMATICAS. - 2-feniletilamina - Octopamina - Triptamina e Histamina - Dopamina 9. DERIVACION DE LA RUTA METABOLICA DE LA TIROSINA A TRAVES DE LA RUTA DE DEGRADACION DE TIRAMTNA Y 4-OH­PHAC EN P. PUTIDA U. 10. APLICACIONES BIOTECNOLÓGICAS. CONCLUSIONES. BIBLIOGRAFÍA.

QUÍMICA ORGÀNICA II. EXERCICIS
Aquest manual constitueix el material didàctic corresponent a les classes pràctiques o seminaris de l?assignatura Química Orgànica II, que s?imparteix durant el segon semestre del primer any del Pla d?estudis de 2002 de l?ensenyament de Farmàcia..El manual consta d?una introducció, on es revisa molt breument la reactivitat bàsica dels principals compostos funcionalitzats amb enllaços senzills, estudiada a l?assignatura precedent Química Orgànica I, i de tres capítols que corresponen als tres blocs temàtics del programa teòric de l?assignatura («Compostos funcionalitzats amb enllaços múltiples carboni-carboni», «Sistemes aromàtics» i «Compostos carbonílics»). A cadascun d?aquests capítols es pot trobar, a més d?un repàs de les principals propietats i reaccions dels compostos estudiats i una visió esquemàtica de les interconversions que afecten els diferents grups funcionals, un conjunt d?exercicis i problemes per posar en pràctica les qüestions prèviament estudiades a les classes teòriques.